Михаил Маневич, учитывая дружбу с Трабером, на все это не обращал внимания. Но в 1997 году он должен был пойти на повышение – Чубайс предложил Маневичу должность заместителя председателя Госкомимущества. Перед переездом в Москву глава КУГИ решил завершить все дела в родном городе, в том числе выполнить, наконец, распоряжение Чубайса о переводе 28,8% акций в разряд обычных. Трабер отговаривал приятеля от такого шага, ссылаясь, что он «перейдет дорогу» массе опасных людей. Источники тогда рассказывали, что Маневич извинялся, но настаивал на необходимости принятия подобного решения. Осуществить его он не успел — был застрелен снайпером.
Трабер был далеко не единственным человеком, который получал большие прибыли от МП. Значительная часть элиты и криминального мира Петербурга кормилась от МП. Тут были и Кумарин, и Константин Яковлев, и Геннадий Петров, и «воры в законе». Список можно продолжать долго. Нынешний глава "Газпрома" Алексей Миллер в 1996-1999 году был директором по развитию и инвестициям ОАО "Морской порт Санкт-Петербург". Председатель правления "Газпромнефти" Александр Дюков с 1996 по 1998 год занимал должности финансового директора и генерального директора ЗАО "Петербургский нефтяной терминал", а потом стал гендиректором МП. Руководящие должности в порту занимали также советник президента РФ Игорь Левитин и генеральный директор ОАО "ЛенморНИИпроект" Игорь Русу.
«Миллер тогда как раз обретался в порту у Саши Дюкова, а Владимир Владимирович ушел на хлебную должность. Думаю, что финансово Путин опирался на описанную структуру и, конечно, на порт в большой степени», - рассказывал в интервью «Радио Свобода» гражданин Израиля и России Максим Фрейдзон, который знает всю питерскую элиту того времени и лишился доли в ЗАО "Совэкс", которым владел вместе с Дмитрием Скигиным.
Скигин (умер в Ницце в 2003 году) тоже был крупным бенефициаром от доходов МП. Бывший коллега Путина по КГБ Виктор Корытов был миноритарием и заместителем гендиректора «Совэкса». Он также был совладельцем информационно-юридического бюро «Петер» вместе с Трабером. Таких «цепочек» можно выстроить бесконечно много.
В 2011 году наши источники склонялись к тому, что приказ об устранении Маневича не был результатом решения одного человека, а обсуждался в узком кругу всех заинтересованных лиц. В результате "заказ" на ликвидацию вице-губернатора мог поступить и киллерам Шутова, и банде Андрея Челышева, и киллерам Кумарина.
Стоит отметить, что после убийства Маневича ситуация с МП развивалась не в пользу государства. 18 ноября 1997 года было проведено внеочередное собрание акционеров, которое решило передать управление портом ЗАО "ОБИП", подконтрольному Траберу. Как позже установила Счетная палата, после этого МП начали растаскивать "на куски". К 1999 году почти в два раза снизилась доля участия МП (а соответственно и государства) в ряде самых крупных и прибыльных "дочерних" структур порта. "К концу 90-х годов фактически все основные производственные функции портовой деятельности (погрузочно-разгрузочные и перевалочные работы, складские операции, функции портофлота и др.) полностью перешли от Общества (ОАО "Морской порт Санкт-Петербурга" — "РЕД") в сферу бизнеса иных частных компаний", — говорилось в отчете Счетной палаты. Такой дележ был выгоден всем участникам данной истории. А вопрос о том, чтобы сделать 28,8% акций обыкновенными, после смерти Маневича не поднимался вплоть до 2004 года, когда уже весь МП был «растащен». "В вопросах утраты бизнеса Общества в пользу иных компаний представители интересов государства никак не проявили себя", — отмечают аудиторы СП.